Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUFT1Q9NNX1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms