Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNW7

TXNRD2, Thioredoxin reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD2Q9NNW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TXNRD2Q9NNW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TXNRD2Q9NNW7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD2Q9NNW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms