Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9N2J8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9N2J8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9N2J8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9N2J8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9N2J8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9N2J8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9N2J8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9N2J8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9N2J8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9N2J8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9N2J8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9N2J8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9N2J8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9N2J8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9N2J8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9N2J8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9N2J8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9N2J8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9N2J8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9N2J8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9N2J8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9N2J8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9N2J8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9N2J8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9N2J8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9N2J8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9N2J8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9N2J8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9N2J8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9N2J8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9N2J8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9N2J8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9N2J8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9N2J8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9N2J8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9N2J8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9N2J8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9N2J8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9N2J8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9N2J8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9N2J8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9N2J8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9N2J8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9N2J8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9N2J8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9N2J8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9N2J8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9N2J8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9N2J8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9N2J8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms