Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNA4Q9HCM2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNA4Q9HCM2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms