Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAT1LQ9HCJ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAT1LQ9HCJ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms