Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ5

ZSWIM6, Zinc finger SWIM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM6Q9HCJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZSWIM6Q9HCJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZSWIM6Q9HCJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
ZSWIM6Q9HCJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZSWIM6Q9HCJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM6Q9HCJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms