Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ELL3Q9HB65 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ELL3Q9HB65 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms