Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF2Q9HAU4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms