Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A3Q9HAS3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A3Q9HAS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms