Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1BQ9H9Y6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms