Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NHEJ1Q9H9Q4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NHEJ1Q9H9Q4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHEJ1Q9H9Q4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms