Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVMER34-1Q9H9K5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms