Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRDE2Q9H7Z3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRDE2Q9H7Z3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms