Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRABDQ9H4I3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRABDQ9H4I3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms