Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RWDD1Q9H446 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms