Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MED28Q9H204 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MED28Q9H204 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MED28Q9H204 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MED28Q9H204 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED28Q9H204 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED28Q9H204 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms