Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LSG1Q9H089 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSG1Q9H089 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LSG1Q9H089 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms