Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2J2Q9GZM3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms