Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BHLHE41Q9C0J9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms