Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12CQ9C0D7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms