Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM9Q9C026 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM9Q9C026 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms