Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLDIP3Q9BY77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLDIP3Q9BY77 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms