Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM43Q9BTV4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms