Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2AFJQ9BTM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms