Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAGR1Q9BTK6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms