Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms