Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRACR2AQ9BSW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms