Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG101Q9BSB4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG101Q9BSB4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms