Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM175Q9BSA9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms