Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C20orf78Q9BR46 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms