Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FYCO1Q9BQS8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FYCO1Q9BQS8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms