Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BPIFA3Q9BQP9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BPIFA3Q9BQP9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms