Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPIN3Q9BQK8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPIN3Q9BQK8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms