Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM7Q9BQ49 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms