Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF15Q99988 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GDF15Q99988 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms