Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms