Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3AQ99856 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms