Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5SQ99766 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5SQ99766 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5SQ99766 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5SQ99766 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5SQ99766 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5SQ99766 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5SQ99766 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5SQ99766 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5SQ99766 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5SQ99766 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms