Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms