Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIGMAR1Q99720 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms