Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MEIS3Q99687 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms