Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC62Q99442 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC62Q99442 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC62Q99442 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms