Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETDB2Q96T68 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SETDB2Q96T68 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETDB2Q96T68 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETDB2Q96T68 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms