Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK5RAP2Q96SN8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms