Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NODALQ96S42 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NODALQ96S42 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NODALQ96S42 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms