Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms