Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC38A2Q96QD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A2Q96QD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms