Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A9Q96Q91 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC4A9Q96Q91 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms