Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN4Q96NY8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NECTIN4Q96NY8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN4Q96NY8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms