Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIC6Q96NY7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIC6Q96NY7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIC6Q96NY7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms